In enger Zusammenarbeit mit der Abteilung für Kinder-Hämato-Onkologie werden sie nach den jeweils aktuellen Richtlinien aufgearbeitet und klassifiziert. Bei Verdauungs- und Gedeihstörungen der Kinder (z.B. durch Mb. Hirschsprung) werden Biopsien aus dem Magen-Darmtrakt am Gefrierschnitt mit den dazu nötigen enzymhistochemischen Verfahren untersucht.
Das Labor für Pädopathologie bearbeitet auch Präparate aus Schwangerschaft und Perinatalperiode wie das Curettagematerial nach Aborten und Obduktionsmaterial fehl- und totgeborener Kinder.
Ein weiterer Schwerpunkt ist die spezialisierte Aufarbeitung von Plazenten aus Risiko- oder Mehrlingsschwangerschaften, die wertvolle Aufschlüsse über den Hergang von Schwangerschafts- oder Geburtskomplikationen liefert.